男性不育症的原因较多，主要分为三大类：即性功能正常性不育症、性功能障碍性不育症、遗传性疾病引起的不育症。

●性功能正常性男性不育症，主要是由精液异常引起。主要包括导致少精子、无精子的原因有隐睾、精索静脉曲张、染色体异常、毒性药物、不良生活习惯、不良生活环境等因素，引起睾丸产生精子功能障碍，先天或感染因素所造成的精子输出的通道梗阻等；导致精子活力低下、减退、畸形率增加、顶体反应能力减弱等因素有慢性前列腺炎、生殖系统结核、淋球菌感染、沙眼衣原体、解脲脲原体、人型支原体等非特异性感染等；精液不液化也是不育症的常见因素，主要是由于精囊分泌果糖的功能发生障碍。如上因素，夫妻均可以有正常的性生活，外观看上去没有什么异常，患者往往不愿意检查，只是在大夫的要求下通过系统检查才可以发现。其实这些因素是常见的不育因素，检查并不困难，只要认真配合，是可以查清的。

●性功能障碍性不育症主要为精子不能正常进入女性生殖道，无法完成正常的精卵结合。常见的因素有心理性、血管性、内分泌性及其部分药物性等因素引起的性功能障碍，这些因素往往导致不能完成正常的性交，或阳痿，或不射精，或将精子射入膀胱，总之无法将精子射入女性生殖道，无法完成精卵结合的基础“工作任务”。之外，如果外生殖器损伤、缺损或畸形，也会影响性生活，造成男性不育症。

●遗传性疾病引起的男性不育症有性染色体异常、常染色体畸变、减数分裂染色体异常等，一般表现为少精子或无精子，即使有精子发育也往往停滞于精母细胞水平，而不能继续分化为精子。这样的疾病，一般性功能属于正常，没有其他方面的明显异常。之外，免疫性不育也是颇为常见的不育因素，如男性抗精子抗体常常与精子膜表面结合而干扰精子在宫颈黏液中的运动方向，影响精子顶体反应，阻碍精子穿透卵子透明带的能力，导致不能形成受精卵。不仅如此 , 抗精子抗体阳性可以直接导致精子数量减少或质量低下，使精子丧失受精能力，出现有精子却没有生育能力、有性功能却不能使妻子受孕的遗憾。

●不可忽视的还有，放射线、部分金属元素、部分药物、酒精、农药、化肥、不良环境、部分食物、部分不良习惯、过量吸烟等因素，也可影响睾丸生精上皮功能，引起精子数量减少或者质量下降，甚至出现无精子的病情。如果影响到睾丸功能，出现睾酮水平低下时还会导致性功能障碍，出现阳痿等。