输卵管性不孕的治疗主要根据病因和病情轻重来选择治疗方案。输卵管炎是其中的重要原因，首选药物治疗。根据细菌培养和药敏试验选用抗生素治疗。注意输卵管炎常为需氧菌和厌氧菌混合感染，注意加用甲硝唑或替硝唑静脉滴注或口服。炎症消退后输卵管不通或通而不畅者可经宫腔通液。在月经周期反复行输卵管通液术，为期 3个月左右。所用液体包括生理盐水，地塞米松5毫克，糜蛋白酶4000单位及妥布霉素8万单位。Salomy报告40例患者应用该办法，32%妊娠。

经宫颈输卵管导管疏通术是治疗输卵管不通的另一方法。 1966年Corfman和Taylor报道应用一金属导管进行选择性输卵管造影术后，又有很多研究报告使用输卵管导管术，使输卵管的诊断和治疗方面有了新的进展。经宫颈输卵管疏通术或宫腔镜下应用同轴系统或简单套管导管，将导管或导丝或硬膜外导管，经宫颈输卵管口，插入输卵管近端"阻塞"部位；疏通无形物质和轻微管腔粘连，继而通液或直接经插入的导管通液，以期恢复单侧或双侧输卵管通道，达到受孕目的。

药物保守治疗无效者可行输卵管重建术。输卵管重建术成功的重要先决条件是适应症的选择。手术前评估不孕患者的最重要检查是子宫输卵管造影和腹腔镜检查，子宫输卵管照像可以显示子宫腔和输卵管管腔情况，腹腔镜检查观察到这些器官和腹膜内其他结构的外部情况。目前除大体手术外，显微外科技术已日益增多。显微手术技术是使组织结构最精细地接合起来和避免产生粘连和纤维变性。使用特别设计的精密器械，采用精细的缝合技术，保证最小的组织创伤并尽可能重建正常解剖结构，可争取到最好的预后。所以说输卵管阻塞手术复通成功率决定于阻塞的病理变化与手术的方法和技术。输卵管破坏比较大的、范围比较广的，成功率极低。破坏虽比较严重，但范围未累及整个输卵管，尤其远端及其周围比较正常，复通成功率较大。

对于不适合手术重建输卵管的患者应及早接受辅助生育技术的帮助。