生殖器疱疹的初次发作通常出现在与有活动性感染的人发生性接触后 2 ～ 12 天。当病毒在神经节内复制，病毒颗粒沿神经纤维运送至皮肤或粘膜的原发感染部位（如口腔、阴道的湿润的内壁等部位）时，即发生疱疹的复发。虽然尚不知病毒再活动的次数为何变化很大的确切原因，但可将疱疹复发的诱因分为物理性和心理性两类。

物理性诱因

物理性诱因存在个体差异。疲劳、同时患其它生殖器感染（影响到局部皮区）、月经、酗酒、感染区域受强烈日光照射、引起人们免疫缺陷或不全（机体的免疫系统不能正常运行）的情况、长期紧张、紫外线（在少数情况下）等因素，均能触发疱疹的复发。皮肤的磨擦或损害，如由性交造成的这些损伤，也可导致复发。总之，任何引起机体免疫系统功能下降或引起局部损伤的因素都能触发疱疹的复发。

心理性诱因

近来的研究表明，长期的精神紧张能够引起疱疹的频繁复发。而疱疹的复发，反过来也常常导致紧张和焦虑。